实验室科研环境条件良好，现有实验室总面积8500平方米，实验室包括海洋渔业资源养护与可持续利用、渔业环境保护与生态调控、水产种质资源保护与利用、海水养殖生物疾病控制、海水健康养养殖及渔业工程技术等功能实验室。拥有价值5万元以上的大型仪器设备85台（套），原值总计为2589.3万元。主要有离子色谱仪、气相色谱仪、红外光谱仪、库尔特计数及粒度分析、全自动元素分析仪、蛋白纯化系统、研究级显微拉曼光谱仪、snp分析系统、遗传分析仪、纯水系统、液质联用仪、二氧化碳临界萃取仪、高效液相色谱仪、流动注射分析仪、手提测渔系统、原子吸收分光光度计、正置荧光显微镜、超速冷冻离心机等等大型仪器设备。
近年，实验室不断加大条件建设力度，实验室还将新增一批大型仪器设备支撑未来研究方向，使实验室的科研条件达到了同类研究的国内先进水平。
